Budowę Stacji Uzdatniania Wody w Zatorze rozpoczęto w październiku 1975 r. Inwestorem bezpośrednim był Urząd Miasta i Gminy w Zatorze natomiast inwestorem zastępczym było Wojewódzkie Przedsiębiorstwo Wodociągów i Kanalizacji w Bielsku-Białej – Zakład nr 3 w Oświęcimiu. Rozruch obiektu i podanie wody do miasta nastąpiło 20 października 1977 roku.

Zakład Gospodarki Komunalnej spółka z ograniczona odpowiedzialnością powstała w wyniku przekształcenia Samorządowego Zakładu Budżetowego na podstawie uchwały Rady Gminy nr XXVII/200/12 z dnia 29 maja 2012 r. Została ona powołana aktem notarialnym 3174/2012 z dnia 31 maja 2012 roku.